С 1960г. работает на заводе «Дагдизель». В 1990г. стал главным конструктором систем аналитического проектирования особого конструкторского бюро «Дагдизеля». Автор фундаментальных работ: «Фундаментальные технические комплексы. Теория аналитического проектирования» (1997г.), «Низкочастотное звукоизлучение развитых кавитационных течений» (2000г.), энциклопедия - многотомник «Торпедное оружие» (7 томов, продолжение следует), монография «Торпедная гидрогазодинамика», «Морская техника и системы вооружения», «Создатель математической модели системы всплытия». Автор задачника по торпедостроению (1000 задач).

В его лаборатории базы знаний имеются 140 тысяч страниц черновиков, стенды, показывающие эволюцию создания и развития торпед во всех странах мира. Автор решения труднейшей проблемы неустойчивости вихревой пелены за крылом конечного размаха.

Автор теоретических результатов по созданию стартовых установок для запуска энергоблока торпед и многое другое.

Лауреат Государственной премии Российского комитета оборонных отраслей промышленности (1995г.); золотой медали Келдыша; золотой медали Циолковского; золотой медали Бармина; кавалер ордена Щит Отечества (2004г.) I степени «За значительный вклад в укрепление национальной безопасности государства».

За последние годы вышли публикации об ученом: «Гений поражений», «Гражданское общество: смысл и становление», «Ш.Алиев - человек-легенда», «Загадка старого Тамура», «Шамиль Алиев - ученый, философ, гуманист».

По инициативе известного Российского журналиста В. Татарова создан телевизионный проект «Академик Шамиль Алиев. «Верю в человека», состоящий из нескольких серий: «Дети», «Общество», «Наука» и т.д. (об общественно-политической жизни и гуманитарно-просветительской деятельности ученого).

6 августа 2009г. Международный Астрономический союз и Российская Академия наук приняли решение о присвоении малой планете Солнечной системы (под №13046 и обозначением 1990 QB 19) имени генерального конструктора САПР Шамиля Алиева. Официальное свидетельство подписал вице-президент РАН, академик, лауреат Нобелевской премии профессор Ж.И.Алферов. Отныне в астрономических каталогах мира указанная планета будет значиться под именем «ALIЕV». Благодаря великому ученому Дагестан уже навечно поселен во Вселенной!

Шамиль Гимбатович Алиев – академик. Доктор технических наук. Профессор прикладной математики и вычислительной техники (1984). Почетный академик Академии космонавтики (1991). Заслуженный деятель науки и техники РФ (1983). Генеральный конструктор САПР противолодочных комплексов завода «Дагдизель» (1983). Член российского национального комитета по теоретической и прикладной механике.

Руководитель института прикладных программ и моделей «Регион, мир и интеллект», учрежденного Ассоциацией содействия международному центру научной культуры - Всемирной лаборатории.

Руководитель физико-технического и математического направлений в комиссии РАН академика В.Субботина.

Сопредседатель международного форума «Мир против войны» (г. Москва).

Советник Председателя Госсовета и Правительства Республики Дагестан по вопросам науки и ВПК.

Крупный общественно - политический деятель.

Основатель и руководитель республиканского общественно - гуманитарного института «Наследие Чанка - Махмуда».

Заведующий кафедрой ТК и САПР Дагестанского Государственного технического университета.

Выдающийся ученый включен в Российскую Морскую Энциклопедию; в 40-томную энциклопедию Российской Академии наук (раздел «Корабли и суда»). Признанный во всем мире теоретик управляемого подводного оружия.